Новая база данных, разработанная испанскими учеными-биологами, была помещена в открытый доступ. Теперь услугами этой базы могут воспользоваться все желающие, а основными ее пользователями станут ученые-фармацевты и биологи, разрабатывающие новые лекарственные препараты и методики лечения заболеваний. Эта база, имеющая название MoDEL, содержит данные о движениях более чем 1700 видов белковых молекул, входящих в состав человеческого организма, что делает ее самой крупной в мире базой данных в этой области.
База данных MoDEL была разработана на основе данных, полученных посредством интенсивных вычислений суперкомпьютера, находящегося в центре Barcelona Supercomputing Center. Используя эти данные и данные из международной базы данных Protein Data Bank (PDB) ученые создали новую базу, на этот раз базу не просто структуры белков, а видеоинформации, демонстрирующей движение белковых молекул. Каждый из 1700 видов белков, представленных в базе, демонстрируется, используя последовательность из 10000-100000 снимков, демонстрирующих движения и превращения сложной структуры белковых молекул. Конечно, 1700 из 40000 видов белков человеческого организма это не так уж и много, но и эта цифра представляет собой уже 40% от общего количества известных ученым белков с изученной структурой.
Так чем же примечательно создание такой базы? Благодаря собранным данным ученые-фармацевты смогут начать разрабатывать новые виды лекарственных препаратов, воздействие которых направлено исключительно на один или несколько видов белков, которые повреждаются в результате того или иного заболевания. Это область, где наработки, сделанные в течение прошедших двух десятилетий, только начинают приносить первые результаты, открывая перед людьми тайны человеческого генома и позволяя создавать новые методы лечения всевозможных заболеваний начиная от простуды и заканчивая онкологическими заболеваниями.
Эта новая база, доступная сейчас онлайн исследователям во всем мире, и насчитывающая только 1700 записей, является только первым шагом. По мере того, как в ходе различных исследований будут получены данные о новых видах белков, база MoDEL будет постоянно пополняться. По предварительным прогнозам уже через два-три года база MoDEL охватит до 80% всех белков человеческого организма.