Ученые разрабатывают новый общедоступный анализатор генома.

ДНК


Ученые из Медицинского колледжа Альберта Эйнштейна университета Иешива (Albert Einstein College of Medicine of Yeshiva University) разработали новый настольный анализатор генома. Устройство работает в паре со специальной программой-браузером, который позволяет биологам быстро и легко выполнять обработку и анализ потока информации, поступающего с устройства анализатора генома. Это общедоступное (open-source) программное обеспечение называется GenPlay и его подробное описание было опубликовано в последнем выпуске журнала "Bioinformatics".

С использованием нового программного обеспечения процедура обработки и анализа полученных данных может проводиться специалистом в области информационных технологий, что позволяет ученым-биологам сосредоточиться на других, более важных делах, на планировании и проведении экспериментов, на научных исследованиях. Именно в этом и может помочь ученым программа GenPlay, которая является легким в использовании многоцелевым инструментом, и который выполняет функции визуализации, анализа и преобразования исходных данных в понятные биологам образы и представления.

"Впервые полный геном человека был получен 10 лет назад международным консорциумом ученых, стоимость работ в то время составила 7 миллиардов долларов" - рассказывает Эрик Бухэссира, один из разработчиков программы GenPlay. - "Сегодня полный анализ генома может быть получен уже за 10 тысяч долларов, а через несколько лет стоимость таких работ снизится до уровня ниже тысячи долларов. Такое снижение стоимости привело к появлению такой лавины новых научных данных, что ученые-биологи не в состоянии проанализировать эти данные. Программа GenPlay и предназначена для облегчения анализа этих данных".

В настоящее время существует более дюжины различных программ, предназначенных для работы с генной научной информацией. Но программа GenPlay имеет по сравнению с ними множество преимуществ, самым главным из которых является ее общедоступность и открытость ее исходных кодов и форматов данных. Помимо наличия собственного формата данных, программа GenPlay может импортировать данные из трех самых распространенных форматов хранения генной информации. И, естественно, как сама программа GenPlay, так и ее исходные коды могут быть получены онлайн любым желающим, кто испытывает потребность в подобном инструменте.




Ключевые слова:
Анализ, Геном, Программное, Обеспечение, Визуализация, Обработка, Анализ, Данные, Информация, GenPlay, Open-Source

Первоисточник

Другие новости по теме:
  • Ученые впервые секвенировали полный геном осьминога
  • Создана новая система, способная произвести полный анализ генома человека в ...
  • Разработана новая технология, позволяющая дешево выполнить полный анализ ге ...
  • Медики впервые поставили диагноз болезни, используя анализ генома человека.
  • В IBM создали микрочип, анализирующий последовательность ДНК.




  • 14 июня 2011 12:00
    #1 Написал: FomaNeverujuwij

    Публикаций: 0
    Комментариев: 3773
    Радует меня расширение сферы open-source. Может и получится в недалеком будущем соскочить с иглы дяди Билли энд Ко.


    --------------------
        
    14 июня 2011 17:20
    #2 Написал: gendalf

    Публикаций: 0
    Комментариев: 614
    FomaNeverujuwij, несравнимые вложения и организованность имхо.. Вряд ли корпорации уйдут, IBM уже больше века существует. Просто перестроятся под новые условия
        

    Информация

    Посетители, находящиеся в группе Гости, не могут оставлять комментарии к данной публикации.